柱子截面大、刚度就大、内力分配的就大，所以配筋会大些。

但是有些情况是截面取大时，配筋和小截面时相差不大。所以我想既然这样还不如取小截面，但是因为配筋率达到4%，感觉有点大了，所以现在有点犹豫。

这个我赞同，不知道规范上怎么说

这个问题不是很具体，项目描述不是特别仔细。具体问题要具体分析，若是框架结构，你说的这种情况有可能是局部情况，应该不是整体情况。在荷载与楼层情况不变的情况下，所有柱截面都调大的情况下，如果柱截面前后变化不是特别大时，应该结果不会有太大的变化，因质量和刚度都变化不大，周期也就变化不大，水平地震力不会有太大的改变，弯矩自然不会有大变化，当然你若是局部调整几根柱，有可能局部这些柱的配筋会变大，原理很简单，水平地震力没多大改变，但柱承担水平力由自身刚度决定，刚度大，分配的力则大，当然配筋要增大。这里也只能做简单的分析，你应该根据实际情况找原因。

你这个是梁转换柱的情况，下面转换梁刚度很大，但同时上面的柱子不可能作大。

若参数调整里面有转换构件这个选项，试下，同时建议把下面车库对应柱子也伸到宿舍层，柱截面可为400ｘ４００，对使用影响不是很大，都比不上结构安全。