一是分清责任，分别计算费用。由于施工不当或施工错误造成的，与正常程序相同，但监理工程师应注明原因，此变更费用不予处理，由施工单位自负，若对质量、工期、投资效益造成影响的还应进行反索赔；由设计部门错误或缺陷造成的变更费用，以及采取的补救措施，由监理单位协助业主与设计单位协商是否索赔。
二是工程变更应视为原施工图纸的一部分内容；所发生的费用计算应保持一致，并根据合同手段按当地有关政策进行费用调整。
三是变更削减的内容。也应按程序办理费用削减，若施工单位拖延，监理单位可督促其执行或采取措施直接发出削减费用估算单。
四是合理化建议的办理、奖励、提成另按有关规定办理。
五是工程变更造成的工期延误或延期，则由监理工程师按有关规定办理。
六是承包人自身原因导致的工程变更，承包人无权要求追加合同价款。
凡是没有经过总监理工程师认证并签发的工程变更一律无效；若经过总监理工程师口头同意，事后应按有关规定及时补办工程变更手续。