我本来想回答说“要关闭”，但是又发现楼主的最后一句话说的不明不白：既然你说“不合用的系统”，那就是两个独立的系统了，怎么又说“同一系统内”呢？楼主的语文恐怕有问题。

我要表达的是与之排烟有关的通风、空调系统，把它们认为是一个大系统，不对吗？

你说“要关闭”，但规范无此条规定，有必要么？

空调系统是肯定要关的，这似乎是不言而喻的常识。
平时排风系统也要关闭，因为其风机和风管都不能适应高温烟气，会导致烟气的扩散。
平时送风系统如果同时用于火灾补风，那就不关闭；否则也要关闭。
你说的“一个大系统”是一个宽泛的不严谨的定义。要是这么定义，那我可以把整个大楼的所有空调设备也叫做“一个大系统”了。一般来说，通风管道在正常情况下连通在一起的才叫一个系统。

如果是工艺排风，还是不关为好。

为什么?

连锁关闭

主要是考虑工艺排风和对火灾影响两方面的危害性，这个和工艺排风管道穿越防火墙不加防火阀是一个道理。

排烟系统启动后，同一系统内的空调机关闭、送风系统运行作为补风，如设计双速排烟风机者转高速运行，如排风、排烟风机单设者启动排烟风机，排风系统关闭排风口开启排烟风口。这是我的理解，仅供参考。

什么是工艺排风？凭什么它不关？“工艺排风管道穿越防火墙不加防火阀是一个道理”是什么道理？

火灾发生，应切断非消防电源，平时所用空调电源应强制切换。