水价测算的原则是：还贷、保本、微利；两部制水价；定额用水、差别水价、超额累进加价。

　　依据国家有关规程规范，按供水水量和输水距离，逐段分摊投资，进行成本分析，测算主体工程的水源水价和分水口门水价。根据对水价的承受能力分析，为了使分水口门水价能够被受水区用水户所承受，部分贷款由征收的南水北调基金来偿还。

　　利用南水北调工程基金偿还部分银行贷款本息后，东线山东省分水口门的平均水价为0.59元/m3，中线北京和天津的分水口门平均水价在1.20元/m3左右。

　　在分水口门供水成本的基础上，受水区用水户的水价还要考虑分水口门至自来水厂的配套工程、城市自来水厂及配水管网、污水收集与处理等环节的成本。如果考虑这些环节，初步估算需再增加2.5～3.3元/m3。因此，工程通水后，受水区用水户的最终水价估计为3.2～4.8元/m3，在可承受能力以内。