请教各位：
我们是一个水利工程管理单位，在A处办公。现我们一个水利工程上马开工，工地在B处，AB相距300公里，故我们再施工现场租办公楼办公，从事建设管理工作，但是工程项目中的管理设施设备（包括新设工程管理机构、管理用房等）都未建设，在此期间的工程建设档案应该怎么保管：档案室放在A处吧，距离现场较远，每次检查都要将档案资料尤其是一些公文搬运过来，非常麻烦；放在B处吧，临时租用房，档案室不好建设。我想工程建设（B处）和工程管理（A处）档案资料不要混合存放，分开两地存放，用不同文号解决一个单位发文混合的问题，即工程管理类用“鄂水发***发**号”，工程建设类“鄂综发***发**号”，不知可否？请教各位。