三峡水库２００３年６月蓄水至１３５米，工程进入围堰发电期运行，实现了蓄水、发电、通航三大阶段性目标，开始发挥效益。
　　２００６年５月下旬，三峡大坝全线浇筑至坝顶高程１８５米；与此同时，三峡库区移民已在按水库蓄水位１５６米实施。
　　２００６年９月下旬，水库水位开始由１３５米蓄水至１５６米，至同年１０月完成蓄水，三峡水库进入了初期运行期。预计到２００９年三峡枢纽工程完建，水库移民搬迁任务完成，具备蓄水至正常蓄水位１７５米运行条件，即进入正常运行期。
　　三峡水库设计坝顶高程１８５米，设计正常运行水位１７５米，相应库容３９３亿立方米；设计防洪限制水位１４５米，相应库容１７１．５亿立方米。三峡水库到２００９年进入正常运行期后，遇１００年一遇洪水，通过水库调洪，可控制荆江最大流量不超过５６７００立方米每秒，沙市水位不超过４４．５米，即荆江可以不分洪；遇１０００年一遇洪水，通过水库调洪，可控制荆江最大流量不超过８００００立方米每秒，结合荆江地区分洪区分洪，可控制沙市水位不超过４５米，即通过水库调洪，荆江地区分洪区分洪，可避免荆江两岸乃至江汉平原遭受毁灭性灾害。