本不想回答这个问题，这不是三言两语能说得清楚的问题。
楼主的意思似乎是不想把裙房基础做到地下车库底板以下，这就需要注意以下问题：
1. 高规中的“埋置深度可从室外地坪算至基础底面”，此处的“室外地坪”当位于挖土区时，应取设计标高；位于填土区，就应取室外地坪的天然地面标高。否则就埋浅了。
2. 地规中的“裙房基础”是泛指的，地下车库应按裙房对待；“当不满足要求时必须采取有效措施”，这里的“有效措施”是要求设计采取有效措施，施工单位只知道按图施工。
3. 桩基础——由基桩和连接于桩顶的承台共同组成。若桩身全部埋入土中，承台底面与土体接触，则称为低承台桩基；若桩身上部露出地面而承台底位于地面以上，则称为高承台桩基。建筑桩基通常为低承台桩基础。请注意不要在不经意间把设计的低承台桩变成高承台桩。
上海倾覆大楼的设计就是犯了以上三条错误。一定要记住上海倒楼事故的教训。
楼主的设计有很多种方案可以选择，不过我还是希望不要以身犯险。主楼与裙房（包括地下车库）最好不要连在一起，结构设计就讲究受力明确。

建议脱开做，避免不必要的计算和规范限制

1.目前的情况是地下两层车库要和主楼联体一起施工，而北侧3层的框架裙房无地下室，地下两层车库和主楼之间若留设沉降缝，北侧填土施工裙房，确实存在侧限问题
2.地下两层车库若和主楼设缝分开，主楼埋深及侧限问题还是存在。怎么解决
还请多多指教
以前做过裙房、主楼、车库地下连体，地上设缝分开，但裙房、车库通过独立基础调节沉降以及对边设置沉降后浇带，不存在侧限问题了
3.目前裙房和车库用独立基础和抗水板成为了趋势了，但是您所说的埋深问题，确实存在，即便是地下连为一体
4. 《高规》 《地规》这方面留设沉降缝时保证主楼基础深于裙房2米以上，书中示意主楼两侧都有裙房情况，若只有一侧有裙房情况，再设缝是否也存在侧限的问题？

最近跟楼主碰巧做一个类似的小区 跟楼主略有不同的是开发商为了偷面积将北侧的商业裙房标高往下降了一层这样跟南侧地库回填后还存在一个标高差。希望个人的一点见解能对楼主有所帮助：
1.个人觉得设置沉降后浇带比较好，如果是预留钢筋后施工会存在这样一个问题：难道你的北侧回填土在主体施工的时候不回填吗？那样基础埋深只能从开挖的设计标高算起了（建筑地基基础设计规范5.2.4关于d的解释） ，如果回填 难道你施工独基的时候又开挖？
2.裙房和主体连接是可以做为侧限的，可见建筑地基基础设计规范5.2.4的条文关于超载的说明。
3.可建议车库顶面覆土加厚1m 做为嵌固端，也有总工说过只要不超层高1/3的话，个人觉得还是保守点好，覆土加厚以后入户门头可以升上去的，你懂的。
4.嵌固端是需要侧限的，整体位移参数就是假想它为理想的位移零点吧，至于规范真没找到。
还想请教大家一个问题：就是北侧裙房的独立基础按照1:2的应力扩散后压到主体的挡土墙的时候该怎样处理？

1.裙房独立基础压力扩散问题这个没有得算了哦，我目前将裙房基础做成条形基础了，拿出裙房模型计算了一下，将裙房总重换算成地面堆载，地面堆载主要用来加到主楼地下室外墙来计算地下室外墙的，而您刚才提到如果地下车库覆土厚度达到一定厚度，可以作为侧限嵌固主楼的话，那么北侧裙房对主楼的侧力是可以忽略不计的，毕竟大面积车库吧
2.我所担心的是沉降后浇带必须在相当长的一段时间内不能封上，南侧与车库留有沉降后浇带，这样等同于整个主楼施工的过程中，南侧是没有侧限的。《北京细则》3.10.4条，很清楚的说了这种情况的存在，但是，遗憾的是，原文只是说
“在设计施工图中必须注明，施工单位应将后浇带两侧的构件妥善支撑，并应注意由于留设后浇带可能引起的各部分结构的承载力问题与稳定问题，图3.10.4.-2说明由于设置沉降后浇带，使裙房挡土墙的侧压力不能传递至高层主楼，可能导致施工时发生事故.”
而没有提出怎样去解决由于留沉降后浇带主楼在留有后浇带一侧的侧限问题
3.我目前收集了一些资料，并且简单计算了一下假设主楼一侧没有侧限的情况下，主楼的抗倾覆情况，以及在没有封后浇带之前，由于另一侧回填土对主楼产生的偏心（考虑地面堆载30kn/m2）
这样算下来，心里就踏实一些了，抗倾覆力矩/倾覆力矩=14.24，对主楼产生的偏心大约350mm
在布桩的时候在车库一侧有意多设几根桩（上部无墙肢，下部有墙肢处），这样整体考虑下来就好一点了。

1、裙-房、主-楼、地-下-室-建-议-在-嵌-固-面-以-下-全-部-相-连，嵌-固-端-选-在-负--一-层-顶板。原-因-在-于-若-设-置-沉-降-缝，则-主-楼-有-临-空-面，导-致-埋-深-起-算-点-只-能-往-下-移-，甚-至.可.能.从.基.础.顶.面.起.算.，这.个-很-痛-苦，本.来.有.地.下.室.了，还.要.从...地-下.室.的.基.础.再.往.下.算.埋.深，很-难-接-受。而.且.设.缝.会-牵-涉-到.防-水（.指.主.楼.与.地.下.车..库），而.防-水-材-料.的.使-用-年-限.一.般.在.10~15..年.以.内，使-用-年-限-过.了.以.后，维-修.困.难，造.成.人.为.的.漏.水，总.之.比.较.悲.催.吧。规.-范-上-一.方.面.讲.地-下结.构.的..伸.缩..缝.建.议30~40m.设.置，另-外.一.方.面.又.说.地-下.室.不.宜.设.缝，所.以，看.自.己.怎..么.权-衡-利-弊吧，我.一.般..偏.向.于.不.设.缝.。.沉.降.后.浇.带.比.较.好.。.地.下.一.层.顶.板.与.主.楼.高.差.1...0.m.，.这.个.若.再.往.下.降.1.0m，在.建.筑.上.很.难.实.现.，.可.以.采.取.过.-.度.办.法.，.在.主.楼.与.地.-.下.车.库.相.邻.一.跨.或.两.跨.内.，.地.-.下.室.顶.板.与.主.楼.高.差500，类.似.于.放.阶.，.防.止.高.差.突.-.变.-.太.-.大.；.这.个.需.要.与.-.建-筑-及-.设-备-专-业-协-调，同.时.会.引.起地.-下.-.室.顶.板.荷.-.载.变.化。
2、裙楼与主楼施工的问题，可以一起施工，但是裙楼仅施工至正负零，待主楼主体施工完毕或大部分施工完毕后再行施工，我估计你裙楼不会设置地面的钢筋混凝土板，而采取刚性地坪，那么对于裙楼和主楼而言，只有地拉梁是相连的，这个地拉梁设后浇带即可；回填土照样回填，影响不大。由于不知道主楼桩基础是属于端承桩还是摩擦桩，所以不确定沉降量，（个人表示，沉降这个东西也有点玄乎，算得也是个大概，参考意义真心不大）如果是端承桩，那么沉降差会好一点，裙楼可以根据工程经验及沉降的计算结果判定，将独立基础底面积放大，或不放大。以调节主、裙楼之间的沉降。
3、地下室与主楼的沉降后浇带施工，是很麻烦，也存在施工阶段的安全问题；没有太多好的办法；不过个人认为，对主楼的安全影响不大，前提是主楼在风荷载作用下没有零应力区或小于15%。
4、裙楼的荷载不会太大，通过独立基础传递至主楼地下室外墙的荷载，采用堆载可以，但是偏于保守。（堆载是全高度受力，而独立基础的荷载因为扩散以及埋深作用，仅限于基底扩散面以下，且越深越小。）
5、以上也是个人意见，参考。大家可以一起讨论。

很无语啊，打了一段话，本来准备回复，结果始终说我的文字中间出现不良信息，也不告诉我什么地方，我茫无头绪地纠结了N久，还是不成功，最后我把每个字与字之间都加了个点“.”或者短划线“-”，再点击回复，说是要经过管理人员审核。
算了，不说了，不就讨论个专业问题么？我也搞不清哪里不良了。以后我就看看帖，不说话了。
楼主抱歉啊，本来是想和你一起讨论下这问题的。
说这段话是发牢骚，呵呵，借用你这地儿，别见怪。

也不知道高手们有没有空，有空指教一下吧

我觉得分开做好，只是高层旁边紧挨一个大面积车库！楼主，上海塌楼事件有可能出续集

赞同7楼的观点，只要在不考虑地下室情况下验算倾覆没问题，祈求施工期间不发生地震就是安全的。北侧裙房要是面积不大可以不设缝，整体计算设后浇带。嵌固首先考虑放在地下一顶板，北侧侧限不存在问题，南侧要看车库顶板的结构形式和覆土顶与地下一顶的高差是否超过地下一层高的1/3。还是那句话，要是考虑施工期间没侧限，那你只有嵌固在基础顶了。