苏州博物馆新馆建筑采用地下一层，地面一层为主的结构方式，主体建筑檐口高度控制在6米之内；中央大厅和西部展厅安排了局部二层，高度16米。新馆建筑群坐北朝南，被分成三大块：中央部分为入口、中央大厅和主庭院；西部为博物馆主展区；东部为次展区和行政办公区。这种以中轴线对称的东、中、西三路布局，和东侧的忠王府格局相互映衬，十分和谐。新馆建筑中还设有影视厅、多功能厅、商场等。

新馆建筑群在现代几何造型中体现了错落有致的江南特色，深灰色石材的屋面和墙体边饰，与白墙相配，清新雅洁，为粉墙黛瓦的江南建筑符号增加了新的诠释内涵。