在《工业与民用配电设计手册》（第三版）中297页。

零序电流要看系统的总电容电流以及分配到变压器回路断路器出口处的电流计算。

原则：系统上有单相接地故障时，流过本断路器的电容电流不会让零序保护动作；本断路器下发生单相接地故障时，流过本断路器的电容电流应能使零序保护可靠动作！

副楼主的回答很好，但对零序电流保护的解答不全面，主要是楼主没有把需求说清楚。
为是6kV的配电变压器，单说零序电流会让人有很多的猜测：
1、是6kV侧零序电流保护，但6kV是不接地系统。这时一般是不需要零序电流保护的，若有，也仅仅是原来发接地故障信号，并且选择性不能保证，按副楼主的解答计算，不需要保证灵敏度。
2、是6kV侧零序电流保护，但6kV系统因有高压电动机采用了中性点电阻接地系统，这时要根据设计的接地短路电流（如20A）来进行整定，并且要帮助动作灵敏度（大于2，配合有困难时至少要大于1.5）。
3、6kV侧是不接地系统，不装零序电流保护，楼主所指的零序电流保护是400V侧的，是用于变压器低压侧的后备保护的，则必须按照400V系统的单相短路电流来整定。