分布在内蒙古自治区的有五大流域，按盟市划分如下：
1、黄河流域：乌海市、巴彦淖尔市、鄂尔多斯市、包头市、呼和浩特市、乌兰察布市；
2、海河流域：乌兰察布市、锡林郭勒盟；
3、黑龙江流域：呼伦贝尔市、兴安盟、通辽市；
4、辽河流域：通辽市、赤峰市；
5、内陆河流域：巴彦浩特市、乌兰察布市、包头市、锡林郭勒盟。