首先，根据《建筑地基基础设计规范》(GB50007-2011)规定，塔楼部分地下室与外圈地下室的高差应控制在1m以内。如果高差超出了规范限制，需要根据加固设计和调整结构来解决。其次，在建模时需要将地下室分层，分别设计不同高度的基础和结构，避免出现整体受力不均匀的情况。同时，根据规范要求，在地下室中应设置合适的支撑结构和墙体等来承担地下室上方结构和荷载，确保结构的稳定性和安全性。具体的建模方法和注意事项请参考相关规范条文和专业建筑设计手册。

建筑模型中塔楼部分地下室与外圈地下室有高差时，可以采用以下两种建模方式：1. 在模型中将地下室分别建造，然后再以垂直连接方式连接起来。具体可以先建造外圈地下室的立面墙和地板，然后在底板上建造塔楼部分地下室的立面墙和地板，并设置高度差。最后使用垂直连接工具将地下室连起来。2. 将地下室建造在同一水平面上，并在塔楼部分地下室中设置楼梯或坡道，以模拟高差。具体可以在建模时将所有地下室的底板设置在同一高度，并在塔楼部分地下室中添加楼梯或坡道，来实现不同高度的连接。无论采用哪种方式，都需要结合建筑行业现行规范条文，如《建筑工程地基与基础设计规范》GB50007等文献来保障建筑结构稳定和安全。同时，在建模过程中要注意设置建筑物的各个参数，如地下室的高度、墙壁厚度、板厚等，以便在后续施工时使用。