短程分子蒸馏设备在操作的时候需要注意一定的操纵流程，避免不当的操作导致整个短程分子蒸馏设备不可用以及配套的无锡冠亚制冷加热控温系统不可用。

    一般短程分子蒸馏设备出厂前已经过水压试验和试运转，且指标符合要求。开动电机，观察电机的运转方向是否正确，应是顺时针旋转，不能反转。测量轴的径向摆动和轴向串动量是否符合要求，并检查密封处是否密封严实。减速机的油位是否处于正常状态，机械密封冷却水是否保持畅通。

    打开短程分子蒸馏设备循环冷却水泵，让冷凝器处于运行状态。然后打开浓缩液容器，抽真空阀。打开进料阀，抽入料液。接通电源，启动电机，同时观察电机的转动方向是否正确。蒸汽阀缓慢打开，接通疏水器，使得蒸汽压力为0.15MPa左右。观察短程分子蒸馏设备的出料情况，等到设备稳定运行5分钟后，对浓缩液的浓度进行取样分析，如果浓度不达标，则进行调整。浓缩液容器液面将满时，应切换至另一容易，按步骤进行切换。

    正常短程分子蒸馏设备关机的顺序为：关闭蒸汽阀--关闭进料阀--料液放尽后，关闭出料阀--设备的冲洗--停电机--停循环水泵、喷射泵--打开真空破坏阀。在短程分子蒸馏设备无料液或者液料满的情况下，不能开动电机进行搅拌。电机严禁反向运转，运转时，不能用手触摸转动部位。不能用湿手去按按钮，以防发生触电。