动植物研究实验室建设对于设计来说可能是非常昂贵和复杂的空间。一个双走廊、结污分离的系统在动植物研究实验室设计中将很好地控制污染。双走廊的布置消除了干净的笼子与污染的笼子混合，以及供给于垃圾混合的可能性，减少了交叉污染的危险。一个双走廊布置的主要缺点是要求额外空间和费用。在设计阶段的开始就应当了解，双走廊系统的更大安全性必然需要额外的空间和费用。任何操作期间的人为失误可能导致系统的失效。动植物研究实验室设计的仔细管理对于成功的研究以及相关的人与动物的安全是极端重要的。
交通空间的设计应当关注笼子和动物通过研究所的运动。在许多情况下动物被送到建筑，通过一部专用电梯运送到上层，然后置于一个隔离间内。动物研究 实验室建设一般被置于一座建筑的地下室或顶层以利于保安、机密和安全。假如在地下室和顶层之间做出选择的话，由于靠近排气扇和其他机械设备，顶层是首选的。
在动物呗检查而不再需要被隔离后，它们被取出通过“洁净”走廊送到一个储存室或小房间。当笼架或笼子需要清洗时，他们通过“污物”走廊被送到洗笼处。加入可能的话，首选一个穿过式洗笼机以分离干净侧和肮脏侧。为了减少交叉污染的机会，可以提供多重的屏障，比如入口处的门廊，专用房间入口的前厅，兽房中的小房间或通风架，以及在笼子层中可以独立通风的微型隔离架。洁净走廊应当是正压的而沿着污物走廊应当是负压。
容纳有生命的动物的 实验室建设范围从小型动物（老鼠）的房间到小型和大型动物（包括猫、够、灵长类、羊和牛）的中央兽房。一个中央动植物研究 实验室设计，比如说医学院所需要的，可能包括：
1.动物、食物和给养的接受和检查区
2.隔离区
3.动物的兽房，提供种类的分离和单位工程的隔离
4.用于笼子和设备的洗涤、消毒和储存的建设
5.食物、补给和草甸的储存间
6.外科手术、X光线、验尸和其他程序的实验室
7.管理办公室
8.员工用的淋浴、存衣柜、厕所和餐厅
应当不易从公众或非专业职员逗留的区域看到接收区。在洁净和污染的区域间，职员区域和容纳动物的空间之间必须提供适当的分隔。由于种间传染的危险，物种必须分别安置。
在提供研究者更加实用动物的同时确保每只动物的最低花费是未来动植物研究 实验室建设的一个发展关键问题。
特殊的控制对于包含危险药剂的实验来说是必要的。由规范机构专门制定的安全措施提供了不同等级的密封。正压/负压、高效的空气微粒过滤器、密封舱、无污染区、封闭而通风的笼子系统、双门的高压灭菌器，以及其他措施可能被要求用来维持必要的密封。无菌的手术室要规划用于准备、手术、X光线、恢复和服务（包括储存、洗涤/消毒和存衣柜）的分隔区。设施必须遵守所有规范，包括哪些是用于麻醉气使用的安全措施。
二、空气
系统的空气供给设备应当设计成提供足够量的100%外部空气以利于兽房的充分通风和温度、湿度控制。使用来自动植物研究设施的循环空气或者让循环空气进入动植物研究设施都是不可接受的。为了保持一个无菌环境，要求每小换气在一个幅度。空气流应当用空气阀来控制以防止逆流或倒流。应当在供气和排气管中提供气流监控和控制装置以维持适当的供放空气数量。平衡气阀、气流测量装置和控制设备应当安装在所有供气和排气管道中以监控管道的气流和气压状况。在顶棚上应当有可进入的面板已进行适当的维护。控制器最好位于走廊上方并远离兽房。兽房的排气应当是边墙型的，在房间角落处靠近地板固定。在排气管道中必须安装过滤器以捕捉动物的毛发、毛屑和其他空气传播的固体并防止它们被排放到室外。空气应当向下流动以保护工作人员免受烟雾状微粒的侵害。
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三、机械系统
一个动植物研究建设的加热和通风系统的平均造价是一个普通湿性实验室初始运行费用的3-6倍。所有系统都必须设计成24小时运行。必须提供冗余的具有过滤层的空气供给和排放系统以保证动植物研究建设中的持续服务和运行。假如这个动植物研究设计是研究实验综合体的一部分，要求有一个单独的紧急电力系统来维持电力中断或时效期间的系统运行。
温度和适度取决于每个兽房中所安置的动物种类。推荐每个兽房使用单独的环境控制。应当具有监控温度、湿度和房间压力的传感器；传感器和警报应当连接到一个位于动植物研究设施中心的控制面板，将由连续值班的职员和机构的主要安全办公室来进行监控。在顶棚上应当提供可拆卸的面板（每个兽房最少两个）以灵活地连接管道来适应通风的动物笼子；要求的面积随物种和笼架尺寸而变化。
四、管道
在储存室附近应当提供一个具有螺纹连接的水管龙头。应当有足够的龙头以允许水管能在动植物研究建设中到处使用。应当为储存室提供一条具有滤网、U形管、废物处理单元和螺纹盖的6英寸的排水沟，一条6英寸的排水管，一给排水的倾斜地面。应当安装一个U形管以防止污水倒流回房间。啮齿动物的房间不要求有地板水沟（它可以用真空干燥机干燥或者用拖把抹干）。
五、照明
照明灯具应当防水，可以是吸顶式或吊式（嵌入的灯具可能难以密封来防止昆虫和寄生虫的侵入）。应当控制照明的昼夜循环。小动物的照明等级范围在60-80英尺烛光之间，根据种类而定。在笼房中推荐使用自动照明控制以提供足够的黑暗和光明的时间。昼/夜自动照明控制应当具有手动控制、计时器和警报系统。
