尼尔基水利枢纽位于松花江北源嫩江干流的中游，坝址右岸为内蒙古莫旗尼尔基镇，左岸为黑龙江省呐河市二克浅镇，下游距齐齐哈尔市约 130km。尼尔基水利枢纽是嫩江流域干流上水资源开发利用、防治水害灾害的第一个控制性工程，具有防洪、工农业用水、发电、航运、保护生态环境等综合利用功能。同时该水利枢纽也是北水南调的水源工程，因此分析和评价该工程对生态与环境的影响具有重要的现实意义。
提高防洪标准。工程建成正常运行后，可使枢纽至齐齐哈尔河段的防洪标准由20年一遇提高到50年一遇，齐齐哈尔市防洪标准由50年一遇提高到100年一遇，齐齐哈尔以下到大妾段的防洪标准由35年一遇提高到50年一遇，从而减少下游洪水灾害。优化水资源配置。原嫩江因无水库调节，丰、枯水期流量差别极大，导致了丰水期有大量水白白流掉，而枯水期水资源量又明显不足，满足不了下游各业用水要求。建库后，丰水期流量的减少，平、枯水期流量的增加可改善下游水质，提高各业用水保证率，使年内水资源量在优化配置下更趋合理。
到设计水平年2015年工程可向下条，见效一条。小流域治理好了，大流域的面貌相应得到了改善。 采用人工湿地技术，实现库区水体自净人工湿地是近年来迅速发展的生物一生态治污技术，人工湿地的原理是利用自然生态系统中物理、化学和生物的三重共同作用来实现对污水的净化。具体设想是:在白石水库上游北大公路桥附近，支流凉水河和大凌河干流交汇处开阔的河滩地上，人工种植殖草、菱角、水葫芦、葛蒲和芦苇，构筑生物廊道及人工湿地净化废水，使其在入库之前得到净化，为水库水体筑起了一道污染缓冲带。
在水库的近岸水域，通过恢复水体中、大型水生植物群落、构建库边植物带，引入不同习性的植物，从而实现水体中的沉水植物、漂浮植物、浮叶植物、挺水植物和陆生植物群落的连续性，为水生动物提供了适宜的生境，从而促进水体生态系统的恢复，提高水体的自净化能力。