在给产品性能做最终的物理定义中，聚丙烯酰胺紫外线消毒的物理含义指具有杀菌作用主要是因为紫外线对微生物的核酸酷游产生光化学危害的结果。微生物细胞核当中的核酸可以分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DHA)两大类，其共同点是由膦酸二脂键按嘌呤和嘧啶碱基配对原则而连接起来的多核甘酸链。
聚丙烯酰胺细胞核中的这两种核酸能够吸收高能量的短波紫外辐射。对紫外光能的这种吸收可以使相邻的核酸之间产生新的键，从而形成双分子或二聚物。相邻嘧啶分子，尤其是胸腺嘧啶的二聚作用是紫外线引起的最普通的光化学损害。细胞和病毒DNA中众多的胸腺嘧啶形成二聚物阻止了DNA的复制及蛋白质的合成，从而使细胞死亡，细胞损坏的数量取决于微生物吸收紫外光能的剂量依据微生物对紫外光的抵抗能力。大多数细菌和病毒仅需较低的紫外剂量就可失落。杀菌所需紫外光的剂量随着细胞内DNA或RHA的数量和细胞尺寸的增加而增加，例如，同样条件下原生动物细胞囊对紫外光的耐受力要比肠侵袭性大肠杆菌高10~15倍，这就是聚丙烯酰胺紫外线消毒的物理含义总结。