这种情况是很常见的，最常用的设计思想就是用悬挑的方法，基础埋深相同，在缝处基础梁来挑上面的3层，而基础之间是断开的，这样的缝可算是沉降缝，这种方法适用于建筑不高的情况。另外一种设计方法就是设双柱，基础做在一起，上面设缝，这样缝就可算是抗震缝。但如果建筑高度很高，而且两幢建筑高差很大，那最好要求建筑调方案，让建筑把缝做出来或相交部分上部也做悬挑，移动柱位。

谢谢楼上的解答。工程我已做完，由于地基承载力达60吨，我设的双柱，预留插筋，素混凝土密封。