从本质上没有什么区别，只是97定额是原电力工业部用于替换88概算定额，主要是用于国家电力公司投资的水电项目，是中国首次采用工时、台时的定额，以后陆续发布了2004预算定额和安装实物量定额。
而2002水利部颁发的水利建筑工程概算定额用于大中型水利工程，因为自水利部和原电力公司分开后，在电力部单方面废止了由水利、电力两个部门共同编制的88定额，水利部自已没有一套行业定额后，才组织力量编写的，是水利电力工程投资编制方面首次将模板和混凝土浇筑分开单独列项的定额。
这两部定额有很多共同之处。三峡工程究竟采用的是什么定额没有看到具体的介绍，但从投资渠道和主管部门来分析，国内部分应是采用电力公司的定额和编制办法。

我理解的就是谁投资和主管，就使用谁的定额。

非常感谢2楼主的认真解答。

这有点像电信分家一样，只不过浪费人力/物力/财力。

谁投资、谁主管，就使用谁的定额。
如果是个体或集体投资，尽量先用低的那个就是了。