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方案2这样也可以，按构造手册上按四边铰接这样做竖向荷载下应该没有问题，只不过最近几年强调大跨抗震了，你这样设置中柱子是没有抗震单元了，形成不了中框架了。其实方案一梁未必要均布，你可以靠近柱子紧一点，远离柱子稀疏点，再把结果传上来试试。我是越来越偏于不避开柱子的，satwe的这种较密的次梁输入方法对边柱有局限性，设计时注意一下。

井字梁的问题，一般在pkpm中计算的不太准确，因为程序默认的是主次的计算结果。
做井字梁，可以利用里正，还有旗云，另外手算，可以参考一下，《井子梁计算手册》
上面有很详细的介绍。

个人觉得此两种方案都可以。
楼主说的避柱或不避柱，可能是看到某些文章，提到井字梁的不知应避柱。那篇文章的观点不敢完全苟同。自己设计时，这样的大跨度算细点，可能的话，多用几种方式计算，特别是较大跨度。
不管采用何种方案，个人建议：
1、井字梁现在计算截面偏小，宜取到250~300*800~900。梁宽不宜太小，否则布置钢筋不便且抗剪较弱；梁高不宜太小，16M跨度已经较大了，在控制配置的时候还要做刚度控制，如挠度、裂缝。
2、边梁400*900估计差不多，但在实际配筋时应注意抗扭的控制，此抗扭计算不一定能准确计算出来。
3、井字梁与边梁不建议点铰，不符合实际。

有点井字梁的资料，和大家分享一下：
1、何谓井字梁，以及其注意事项
钢筋混凝土井字梁是从钢筋混凝土双向板演变而来的一种结构形式。双向板是受弯构件，当其跨度增加时，相应板厚也随之加大。但板的下部受拉区的混凝土一般都不考虑它起作用，受拉主要靠下部钢筋承担。因此，在双向板的跨度较大时，为了减轻板的自重，我们可以把板的下部受拉区的混凝土挖掉一部分，让受拉钢筋适当集中在几条线上，使钢筋与混凝土更加经济、合理地共同工作。这样双向板就变成为在两个方向形成井字式的区格梁，这两个方向的梁通常是等高的，不分主次梁，一般称这种双向梁为井字梁(或网格梁)。井字梁的支承井字梁楼盖四周可以是墙体支承，也可以是主梁支承。墙体支承的情况是符合计算图表的假定条件：井字梁四边均为简支。当只有主梁支承时，主梁应有一定的刚度，以保证其绝对不变形。井字梁截面高度的取值以刚度控制为主，除考虑楼盖的短向跨度和计算荷载大小外，还应考虑其周边支承梁抗扭刚度的影响。由于井字梁楼盖的受力及变形性质与双向板相似，井字梁本身有受扭成分，故宜将梁距控制在3m以内,一般可按简支端计算。当井字梁周边有柱位时，可调整井字梁间距以避开柱位，靠近柱位的区格板需作加强处理，若无法避开，则可设计成大小井字梁相嵌的结构形式。井字梁楼盖两个方向的跨度如果不等，则一般需控制其长短跨度比不能过大。长跨跨度L1与短跨跨度L2之比L1/L2最好是不大于1.5，如大于1.5小于等于2，宜在长向跨度中部设大梁,形成两个井字梁体系或采用斜向布置的井字梁，井字梁可按45°对角线斜向布置。两个方向井字梁的间距可以相等，也可以不相等。如果不相等，则要求两个方向的梁间距之比a/b=1.0~2.0。实际设计中应尽量使a/b在1.0~1.5之间为宜，最好按井字梁计算图表中的比值来确定，应综合考虑建筑和结构受力的要求,一般取值在1 2～3ｍ较为经济,但不宜超过3.5ｍ。两个方向井字梁的高度h应相等，可根据楼盖荷载的大小，取h=L2/20（有说法取1/15~1/18见PKPM新天地0505）,但最小h不得小于短跨跨度1/30.梁宽=取梁高1/3（h较小时）1/4（h较大时），但梁宽不宜小于120mm。井字梁的挠度f一般要求f≤1/250，要求较高时f≤1/400。井字梁的楼板井字梁现浇楼板按双向板计算，不考虑井字梁的变形，即假定双向板支承在不动支座上。双向板的最小板厚为80mm，且应大于等于板较小边长的1/40

2.井式梁板结构的布置方式：（来源：《混凝土结构构造手册》第三版 中国有色工 程设计研究总院主编）井式梁板结构的布置一般有以下五种，下面分别于以说明。
有关井字梁的布置形式
1、正向网格梁
网格梁的方向与屋盖或楼板矩形平面两边相平行。正向网格梁 宜用于长边与短边之比不大于1.5的平面，且长边与短边尺寸越接近越好。
2、斜向网格梁
当屋盖或楼盖矩形平面长边与短边之比大于1.5时，为提高各项梁承受荷载 的效率，应将井式梁斜向布置。该布置的结构平面中部双向梁均为等长度等效 率，于矩形平面的长度无关。当斜向网格梁用于长边与短边尺寸较接近的情况， 平面四角的梁短而刚度大，对长梁起到弹性支承的作用，有利于长边受力。为构 造及计算方便，斜向梁的布置应与矩形平面的纵横轴对称，两向梁的交角可以是 正交也可以是斜交。此外斜向矩形网格对不规则平面也有较大的适应性。
3、三向网格梁
当楼盖或屋盖的平面为三角形或六边形时，可采用三向网格梁。这种布置 方式具有空间作用好、刚度大、受力合理、可减小结构高度等优点。
4、设内柱的网格梁
当楼盖或屋盖采用设内柱的井式梁时，一般情况沿柱网双向布置主梁，再 在主梁网格内布置次梁，主次梁高度可以相等也可以不等。
5、有外伸悬挑的网格
梁单跨简支或多跨连续的井式梁板有时可采用有外伸悬挑的网格梁。这种布置方 式可减少网格梁的跨中弯矩和挠度。