水经过特定的磁场处理后，水的偶极分子发生定向极化，电子云发生变化，造成氢键的歪曲和局部折裂，使水合分子变成单个水分子的数量增多，这些自由化的水分子占据溶液的各个空隙，从而以致晶体在容器壁上的形成；另外，在洛仑磁力的直接作用下，水合离子或带电颗粒作相反方向运动，该过程中，正负离子或带电颗粒相互碰撞形成一定数量的离子缔合体，这种离子缔合体在水溶液中构成大量的结晶中心，当磁化水的温度不断升高时，会不断地有Ca2+、Mg2+、CO32-离子从水合状态解脱出来，并且CaCO3或者MgCO3的溶解度随温度升高而降低，溶液中过饱和的Ca2+、Mg2+、CO32-离子就会不断的结晶到悬浮在水中的结晶中心去，因此器壁上就少结垢或不结垢。
　　磁化水不仅能防止新垢的产生，还能促使受热面上的老水垢脱落，这是因为磁化水中自由化的单个水分子的数量增多，水的粘力减小，渗透性增强，使水容易渗到块垢的微细间隙中，在受热器壁处的块垢由于高温不仅使渗透的磁化水汽化膨胀，而且器壁与水垢的
热膨胀系数不同产生应力作用，在这两种热应力的作用下，造成块垢松散与破裂，同时在水流的冲击下 ，促使水垢松散与破裂而脱落。
由于设备器壁上不结垢或少结垢，减少了垢下金属的腐蚀程度（该种腐蚀速度是正常腐蚀速度的4-5倍）；由于磁化水的作用，器壁金属离解受到抑制，对该设备起到防止腐蚀作用。水被磁场作用后 ，水中的细菌被杀死，由此起到杀菌灭藻的作用，可抑制设备管道腐蚀物的产生。