应为三级，因为高规考虑到短墙抗震性能较差而将短肢墙的抗震等级提高一级，而整个结构的抗震等仍为三级，所以梁的抗震等级还是应按整个结构的抗震等级来定。

你为什么要定义为二级？
首先应明确你的整个结构是什么样的结构体系？短肢剪力墙属于部分则体系仍然叫一般剪力墙体系，部分短肢剪力墙它的轴压比、抗震等级、配筋等均按一般剪力墙走。这种情况下 你没有必要把它提高为二级。
只有在短肢剪力墙较多时（较多：详附）才对其特殊“对待”
附：黄小坤讲
《高规》第71112 条短肢剪力墙较多的剪力墙
结构如何界定
《高规》第71112 条中所说的“短肢剪力墙较多
的剪力墙结构”, 主要是指结构平面中部为剪力墙构
成的薄壁筒体(常用作楼梯间、电梯间等) 、其余部
位基本为短肢剪力墙的一种结构布置形式, 近几年来
在非抗震地区以及6 度、7 度抗震设防地区的住宅建
筑中逐渐被应用。要提出更具体的量化判断指标是困
难的, 一般情况下, 短肢剪力墙较多的剪力墙结构
中, 短肢剪力墙承受的倾覆力矩可占结构底部总倾覆
力矩的40 %～50 %。因此, 一般剪力墙结构中, 如果
存在少量的短肢剪力墙, 则不必要遵守71112 条的规
定。实际上, 《高规》第71215 条对剪力墙结构中的
独立小墙肢另有专门规定。
设计中, 对于短肢剪力墙较多的剪力墙结构, 结
构布置上宜使两个主要受力方向的刚度和承载力相差
不多。
71112 条第4 款轴压比要求应按第3 款提高后的
抗震等级确定。
71112 条主要是针对抗震设计而言的。