模拟工程量清单招标和工程量清单招标在本质上存在一定的区别。工程量清单招标是指招标人按照工程设计文件中的工程量清单进行投标报价。而模拟工程量清单招标则是在没有明确的工程量清单的情况下，根据设计方案模拟出一份工程量清单并进行投标报价。在实际操作中，模拟工程量清单招标通常用于初步估算工程造价或与设计单位协商确定预算方案，而工程量清单招标则是用于正式的投标报价。需要注意的是，在进行模拟工程量清单招标时，必须严格按照建筑行业现行规范以及相关标准进行模拟和报价，以确保投标的公正性和合理性。

模拟工程量清单招标与工程量清单招标有本质的区别。在工程量清单招标中，用于投标的工程量清单是由招标人编制，并在招标文件中明确列出来的。而模拟工程量清单招标则是由招标人根据拟投标人提供的施工方案和设计图纸等资料，自行编制工程量清单，以此来进行招标，这也是为了避免可能出现的因施工方案和设计资料变更而导致工程量清单不能适应的问题。当然，在编制模拟工程量清单时，招标人需要严格遵守相关法律法规及规范，如《工程量清单计价规范》等，以确保招标过程的合法性和公正性。