YJK中参数设置中，上部结构计算考虑基础结构一般适用于那些上部结构（比如墙体、柱子等）与基础结构有较强的相互作用影响的情况。例如在承重墙的设计中，如果墙的高度超过规范所规定的高度，则需要考虑上部结构计算考虑基础结构。具体细节可能与具体情况有关，在进行设置前需了解相关技术规范及要求。另外，在设置该参数时，需要考虑到工程的安全性和可靠性，并注意满足相关法规规定。

根据《高层建筑技术规范》(GB 50009-2012)的规定，YJK中参数设置中的“上部结构计算考虑基础结构”一项，应当选择在采用基坑开挖或者非完全岩石地基时使用。这是因为在这些情况下，地基的承载能力会受到影响，需要在上部结构计算时考虑基础结构的影响。具体的参数设置和计算方法，建议结合实际情况仔细阅读高层建筑技术规范以及有关专业性书籍和资料。