1、法人责任制不落实，项目管理不规范
　　中小型水利工程项目法人责任制不落实，同时项目管理也不规范。一是在工程项目中存在行政干预、违反建设程序的做法，不乏任意压缩工期、违规操作行为；二是管理松懈，质量管理意识不强；三是资金管理有问题，有压价、拖欠工程款现象；四是招投标不规范操作，虚假招标甚至发包给不具资质的设计、施工单位。这些情况的出现，使工程管理先天不足，质量保障能力较弱。
　　 2、设计质量不高，施工水平低下
　　中小型水利工程由于建设程序不规范，项目前期准备仓促，设计单位选择不当，部分设计人员水平较低、观念落后、思想保守，不能适应社会主义市场经济和现代水利的需要，不熟悉相关规范，未执行强制性标准，导致结构布局不合理，设计深度不够，方案比较不充分，图纸差错较多，设计变更频繁。
　　由于项目管理不规范，施工能力也无法保障。不少水利工程多次转分包，层层收管理费，使得资金流失，经济利益驱使偷工减料行为的出现，缺乏质量控制的意识。施工单位没有完善的质量管理体系，质量把关不严，质量控制手段落后。还有部分工程有地方势力的参与和干涉，不顾相关法律法规，违反建设程序，对资金进行控制，给水利工程质量带来不利影响。
　　 3、监理市场不规范，监理工作不到位
　　由于水利工程实行监理制较晚，监理门槛设置较高，注册执业人员相对较少，导致～些注册监理多处挂名总监之职，真正从事现场监理工作的人员无证上岗，专业配套不全，缺乏专业技术水平高、组织协调能力强、管理经验丰富的高素质监理人才。部分监理单位的角色定位存在偏差，监理工作责任感较差，不愿深入工作，以致“同体监理”、“自行监理”和“兼职监理”等违规行为不绝。
　 　4、法律法规不健全，质量监督力度小
　　目前，水利工程的法律法规建设仍有缺陷，由于项目法人责任制没有真正落实，对一些违法违规行为的处罚很难有效实施，而且质量监督的执法力度也不够，使得质量监督在一定程度上流于形式。由于对质量监督的程序、手段和成果等方面缺少操作性规定，导致各级监督站在工作方式、方法和标准上不尽统一，甚至同一个站内部也不一致。由于人力、财力等原因，水利工程质量监督通常采取巡查的方式，很少采用驻点监督方式，使监督的效能大为降低，监督工作难以深入。