中压高阻接地系统的零序电流，需要根据整个系统的接地电流计算后得出的，不是规范规定的，楼主说的“高厂变低压6.3KV侧不接地，定值是零序电压12V，零序电流50A，各个低厂变，6KV电机都是这个值，都一样，”可能看错了吧？

因为变压器是电源侧，零序电流定值会大一点，系统上设备的零序保护定值应该小一点。
设备发生接地故障时，应该跳故障设备，不应该跳主变！如果定值一样大，不是同时跳吗？

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