新旧建筑统一规划，新建博物馆以4个完整的矩形体量，错落布置，与东侧的双忠祠寻求呼应与平衡，新建展馆实体与老建筑群中的庭院“虚”“实”互存。新建博物馆的建筑体量与双忠祠历史建筑的院落建筑规模相当；竖向高度同样被控制，天际线平缓稳重，新建筑主体最高处与双忠祠最高的启圣殿屋脊持平；新旧建筑之间用植物、当地石材铺地形成横向的缓冲空间，并刻意营造出一系列相互观赏的切口，令观赏者体验到新旧之间“虚”“实”互动的节奏与趣味。

川西民居讲究“天人合一”自然观与环境观，建材以木、石灰、青砖、青瓦为主，墙有砖墙、土墙、石块墙、木墙、编夹壁墙等多种方式。博物馆以就地取用材料的原则设计，经济节约并与环境十分协调，建筑色彩朴素淡雅，力图使建筑表达出质朴凝炼的气质。

建造过程中，施工单位提供的石材总是不能达到

建筑师期望的效果，在某个僻静的角落一块磨盘引起了建筑师的注意，磨盘上人工凿刻的随机凹凸纹理，正是当地工匠技艺的写照。建筑师指导现场施工人员随机雕凿，再比较选取效果接近的样本，最终大量使用在建筑中。