按照生态学原理和系统科学的原则，把“微生物-藻类-底泥”组成一个有机的水体生态净化系统，通过对各种生态因子的调控，使微生物和藻类迅速降解水体中N、P等有机污染物，并形成一个具有良好自净能力的系统，当污水再次进入到重建后的生态系统中时，其中的 污染物得到快速净化。

整个过程其中包括生态控制，生态重建，生态净化理论。