硫酸铜是最便宜的杀藻剂（杀藻剂没错，工业水处理中常用，但现在随着国际铜价的上升，硫酸铜的价格已经比氯制剂的价格高出好多了），很多人认为使用蓝色的硫酸铜会使池水变得蓝蓝的，其实不然，硫酸铜杀藻靠的是铜离子，但铜离子在水中会很容易和水中的氢氧根、碳酸根、氧化剂等结合，形成不溶解性或溶解度很低的淡蓝色的氢氧化铜、孔雀绿色的碳酸铜或黑色的氧化铜沉淀，进而造成池体的着色，影响美观也失去杀藻功能，特别是在游泳池水含氯的情况下使用，此时氯的氧化力足以将铜离子氧化成黑色氧化铜沉淀，进而让管理员又以为游泳池长黑藻而再加重使用硫酸铜，形成恶性循环。
硫酸铜中的铜离子属于重金属，对人体而言算是有毒物质，硫酸铜使用过多时，会使池水有甜甜的口感，泳客的头发经太阳晒过后，可以在发际间发现一颗颗如石英砂般的结晶。
故而一般不建议在游泳池水质管理中使用硫酸铜作杀藻剂。用作游泳池水消毒的氯制剂本身就有很强的杀藻效能，在维持泳池水自由余氯含量0.5~1.0ppm的时候，就已经足够抑制细菌和藻类的生长，如出现外部环境条件变化而长藻的时候，用氯制剂作SHOCK（冲击性处理）已经可以胜任。