栽培设施内的土壤与露地有较大不同，在覆盖物遮挡下，土壤不受雨水淋洗，灌溉水量较小，几乎不发生肥料淋失。另外，土壤湿度较高，使土壤中病原菌迅速增殖，容易诱发病害，影响植株生长。因此，往往会出现盐类积累的危害和其它生理障碍。在生产上往往采用下列措施对土壤条件进行调控。
一、 土壤中盐类浓度的调节
1. 确定合理的施肥量。
对设施内土壤进行定期化验分析，确定最佳施肥量，防止施肥过多造成盐类积累，避免浪费。一般确定化肥施用量时，要考虑计划产量水平、有机肥用量、肥料利用率等因素。
2. 选择适宜的肥料种类。
栽培设施内应选择易被土壤吸附，土壤浓度不易升高，不含植物不能吸收利用的残存酸根的优质化肥。如：尿素、过磷酸钙、磷酸铵、磷酸钾等。这些有机肥释放营养元素缓慢，不易造成土壤盐害，能增加土壤盐基置换容量，提高土壤缓冲作用，并且有改良土壤的作用，宜多施。
3. 以水排盐。
通常采用的方法是：在夏季揭掉覆盖物，接受自然降水的淋洗，或人工漫灌或在附近开挖排水沟，让水带着盐类汇入沟中流走。对于永久性温室可在地下设置固定暗排管道，当植物生长期内发现土壤溶液浓度障碍时，增加灌溉次数和灌溉量。
4. 改良土壤。
在种植期间，深翻土壤，使含盐多的表层土与含盐少的深层土混合，起到稀释耕作层盐分的作用。
5. 换土除盐。
对大型固定温室，可定期换入室外大田含盐少的土壤。如设施构造简陋，换土比搬迁费事时，可将设施迁到新场地。
6. 防止表层土壤积累盐类。
通过地面覆盖，切断土壤毛细管灌水，雨季拆除空中覆盖物使土壤淋雨等，可以防止表层土壤盐类积累。
二、 土壤生物条件的调节
1.更换土壤。
一般每隔3—4年进行一次换土或更换一部分信徒或拆迁设施到新场地进行栽培。
2.土壤消毒。
对于大型设施，可利用药剂对土壤进行消毒。常用的药剂有甲醛（40%）、硫磺粉、多菌灵（50%）、等。蒸汽消毒是土壤热处理消毒中最有效的方法。以杀灭土壤中有害微生物为目的，大多数土壤病原菌用60°C蒸汽消毒30分钟即可被杀死。另外、还可以采用太阳热消毒的方法，既消毒土壤又减少盐分聚集，且节省能源，效果较好。
3.水培的砾石消毒。
水培时常有砾石作基质，在植物栽培前对砾石消毒可用敌克松30mg/kg溶液，在栽培过程中，营养液内保持15mg/kg即可控制发病。敌克松溶解后呈粉红色，被份解后变无色，根据营养液颜色可以识别有无残效，进行调节。