先谢谢各位了

水利局和防汛办是两个机构，一套人马。
这样说吧。水利部是属于国务院的一个派出机构，是属于国务院的一个直属部门。
而国家防汛抗旱总指挥部（简称“国家防总”）也是直属于国务院管辖的部门，里面有很多的成员单位，比如：水利、发改、民政等，由国务院副总理任指挥长、国务院办公厅和水利部部长等任副指挥长。而国家防总只是一个机构呀，要设一个具体办公的地方承办防汛抗旱的日常事务，就将办公室设在了水利部，并由水利部副部长兼任防汛抗旱指挥部办公室主任，还设几个专职的常务副主任，就构成了现在的局面了。
因此对应国务院和国家防总的机构建设，各地方也是一样的建制了。
具体到县一级防汛抗旱系统的话就应该是由县政府分管水利的县长任防汛抗旱指挥部的指挥长，水利局局长等任副指挥长；防汛抗旱指挥部办公室设在该县水利局，由水利局分管防汛的局长或副局长任防汛办主任，并在防汛办专门设置一个防汛办副主任，称专职防办主任。
因而防汛办与水利局其实是两块不同的牌子，一套人员管理。
包括防办工作人员的人士任免、工资制度等相关管理也都是属于水利局代管的。
但防汛抗旱的相关经费是属于专项资金管理，在各地财政局设立有专门的帐户，与水利局的其它科室又有所不同。
不知道我这样的解释是否说得清楚了，反正我觉得防汛办这个机构的设立有点不伦不类的。

上面说的很具体哦。