昆明动物博物馆坐落于中国科学院昆明动物研究所园区内，是一座造型独特、用赭红色手工拉毛砖精心镶砌的别致建筑。
于2000年开始立项兴建，2004年得到云南省文物局关于同意成立昆明动物博物馆的批复，立足于社会公益事业，积极为营造良好的科普教育场馆而努力。
昆明动物博物馆是中国科学院国家知识创新工程的重要项目及中国科学院重点支持的两大博物馆之一，立项之时即给予2600万经费支持，尔后不断得到中国科学院的相关支持。同时，昆明动物博物馆在建设过程中也得到云南省人民政府的高度重视和大力支持，列入院省合作共建的重点项目，同时拨给1000万布展专项经费。到目前为止，昆明动物博物馆已建成为中国最大的动物专题博物馆。
博物馆占地面积为1885平方米，建筑面积7350平方米，由东、西两楼组成，主要由科普馆（展示面积约4800平方米）、科研标本库、多功能学术报告厅等组成。昆明动物博物馆库存标本56万号，展示标本数量为2277号，包括国家一二级重点保护动物90余种，还有许多珍惜、濒危种、观赏种、药用种、资源种及食用种等，实为无价之宝。展览规模庞大，展品丰富精致，充分展现了云南“动物王国”的风采。
展览主要集中在一至三层：一层展览震撼人心：序厅、生物多样性展厅、亚洲象展厅、恐龙及化石展厅、骨骼展厅、两栖爬行动物生境柜和鱼类、两爬类瓶装标本展厅；二层展览丰富多彩：色彩缤纷鸟类标本及其生境的展示、种类丰富的昆虫资源及其生境展示，人与自然、熊猫、湿地三大生态景观淋漓尽致表现生物及其生境的关系；三层展览别致新颖：呈现的是水生生物（含淡水鱼和海洋生物）及其生活环境、滇西北生境的缩影寒温带生境柜和热带-亚热带模拟自然综合大型室内生态景观。创新的设计及布展使整个展厅异彩纷呈，又各具独特亮点。