活性污泥里面的微生物是多重多样的，通过光学显微镜能够看到其中的一部分，主要集中在纤毛类的微生物，比如草履虫，钟虫类等，这一类的微生物数量众多，在光学显微镜的10倍-40倍物镜的条件下，能够准确的观察并计数，因此我们把这一类微生物成为指示微生物的数量多少，活性强弱，优势占有的情况，是镜检工作的主要内容。而对于其它的一些小类微生物，由于本身存在的数量较小，形体较小，较难统计（如豆型虫，滴虫）我们一般不作为指示微生物进行定量统计，只做一些定性描述即可。
活性污泥里面的微生物是多重多样的，通过光学显微镜能够看到其中的一部分，主要集中在纤毛类的微生物，比如草履虫，钟虫类等，这一类的微生物数量众多，在光学显微镜的10倍-40倍物镜的条件下，能够准确的观察并计数，因此我们把这一类微生物成为指示微生物的数量多少，活性强弱，优势占有的情况，是镜检工作的主要内容。而对于其它的一些小类微生物，由于本身存在的数量较小，形体较小，较难统计（如豆型虫，滴虫）我们一般不作为指示微生物进行定量统计，只做一些定性描述即可。
显微镜的操作步骤
1
取样，这个要取曝气末期的，或者即将要停止曝气的混合液，这样能够考察通过抱起以后微生物的变化情况，同时曝气是一个搅拌均匀的作用，能够把活性污泥均匀的分布，在曝气末期的时间取样，能够代表整个曝气池的活性污泥性状。
2
取样后带回化验室，再用滴管取样前，应轻摇搅拌，保持取样瓶底没有沉淀污泥，使瓶内的活性污泥均匀分布，这样取样不会有偶然性的偏差，一般滴管一滴为1/20毫升，就是在最后计算微生物的数量时统计数字要乘以20才是个/ml的数值。
3
同滴管第一滴在载玻片上，用盖玻片一边轻放在水滴一侧，然后轻轻放平，注意在放置过程中不要晃动，不要过快，保证这一滴混合液全部都被盖玻片压住，以不产生气泡为佳。
4
在显微镜下观察微生物，一般先用10倍物镜做数字统计观察，先把盖玻片的一角移动到目镜的视野中心，然后利用上下或者左右，做直线运动，一手匀速的扭动旋钮，保证盖玻片在视野里直线运动，一手调节微调旋钮，随时保证目镜内看到的画面清晰，此时要进行微生物的辨别，统计。盖玻片运动到一端以后再调整左右或者上下换一行再进行直线观察和统计。
5
如有的微生物形体较小不方便观察，这是可直接更换40倍物镜，稍微扭动微调视野清楚之后可继续观察和统计。另外观察玻片的时间不要太长，避免在显微镜底下的光对微生物炙烤或者其它原因对微生物造成死亡，导致最终统计数量不准确。
6
另外微生物的观察要进行长期稳定的观察，并且有连续性。微生物的种群变化是有一定的趋势性的，由于曝气池内的活性污泥浓度高，微生物种群基数大，这些微生物的变化是有一定的变化，从少量到多量，还会再进化成熟，衰老，死亡。这些变化是一种过程，可以通过长期连续性的观察得出。
