花石隧道进口位于宁陕县新场乡菜子坪西河西侧，出口位于马家坪板房沟，地貌上属秦岭南坡低中山区，地形起伏较大。隧道整体埋深较大，一般埋深200-400m，最大埋深约555m。隧道起讫里程Dgk104+22