六里桥东站主体为地下双层外挂岛式车站，其中地下一层为站厅层，地下二层为站台层；外挂部分地下一层为风道和设备用房，外挂部分地下二层为设备用房。车站总长166.00m，总宽20.08m，站台计算长度118