在碗莲的繁殖中，通常采用播种繁殖和分藕繁殖。播种繁殖又称为“有性繁殖”，分藕繁殖又称“无性繁殖”或“营养繁殖”。
播种繁殖
碗莲的播种繁殖，主要用于可心结实的纯系或以选种育种为目的的种植。如果新育成的品种系通过现有的品种多代自交，形成纯系，或杂交种自交，定向选育成为性状稳定的品种，则可建立隔离区大量产纯合种子。
碗莲种籽首先要选择颗粒饱满、充分老熟，保存良好，无虫蛀无霉变，最好母本来源清楚的优良种籽。播种繁殖从3月至7月均可进行，长江中下游地区最好在4月左右进行播种。可把浸种盆直接放置在阳光下催芽，不需要保温，生长也快。在正常气温下，如管理得当，一般当年即可开花。碗莲播种繁殖具体步骤如下：
破壳处理：莲子的果皮具有坚而厚的特殊结构，在种子充分成熟干缩以后，水份和空气不易透入，呼吸作用非常缓慢，处于被迫休眠状态。所以莲子可以在土中埋藏数百年甚至上千年而不萌发也不腐烂，这是莲子长寿的原因。为了使莲子在播种后吸收水分和氧气，打破被迫休眠状态，进入萌发生长，在种子催芽前，必须进行破壳处理，而要恰当破壳，则应先了解莲子的基本结构。
莲子的外层为果皮，由精后的子房发育而成，主要成分为纤维素。在高度角质化的表皮上具有气孔，气孔室直达果皮深处。在果皮中具有栅栏状的细胞，排列紧密，这些构造对种子有很好的保护作用。果皮初为绿色，革质，老熟后转为黑褐色，逐渐变得坚硬。
果皮内包藏着种子。种子由受精后的胚珠发育而来，由种皮及胚两部分组成。受精后的早期阶段本有胚乳，在后期被胚吸收消失，故莲为无胚乳种子。胚由胚芽、胚根、胚轴及子叶4个部分组成。了叶两片，色白，肥厚，对生，贮藏丰富的蛋白质及淀粉，是人们食用的部分。胚芽绿色，具一段短的芽轴、两片互生的幼叶及一个顶芽，两片幼叶的叶柄及对折卷筒状的叶片雏形已可辨认。胚芽基部与两片子叶连接处为胚轴。在两子叶基部凹陷处胚轴的末断为胚根。胚根极不明显，肉眼不能看见，但在种子萌发时，胚根即发育成初生根，突破种皮及坚硬的果皮露出。
莲是倒生胚珠，胚芽着生于种子的顶端，破壳时应击破种子的基端，即种子在花托上着生的一端，也就是莲子凹入的一端。破壳最简便易行的方法是在水泥地面上或粗糙的石头上磨，也可用咬口锋利的新老虎钳夹破种子的基部。也可用锋利的快刀切割外皮，杨德高多年来用修剪果树的修枝剪反持剪法很好，[莲籽就如我们食用的板粟一样的结构]播种前一般只要磨破果皮，见到褐色种皮为止;夹壳时只要在基部夹2～3毫米裂口即可，切勿夹去太深，以免伤胚。浸种一天后，待胚吸水膨胀，果皮吸水变软时，可以用手沿着破壳处剥去果皮的1/3，使胚外露，以利胚芽伸长。
必须注意，剥壳部位不宜过大过多，如果把莲子的硬壳全部去掉，胚芽就会失去保护，极易腐烂死亡。
浸种催芽：将已破壳的种子，浸于50℃左右的温水中。浸种的水要清洁，不含油腻、污物，也不要用高于50℃的水，否则会影响发芽。水温自然下降，最后保持在30℃左右，不宜高于40℃或低于20℃。如水温高于40℃时，种子虽在头一天萌发迅速，但以后生长则受到抑制;水温低于20℃时，则种子发芽生长过于缓慢。家庭少量浸种催芽时可放入保温瓶中保温。温度在30℃的条件下，一般浸种催芽3天即可萌发，胚芽从破口处伸出。
如果怕自己不能掌握不好的话，就控温在25度上下，这样就安全放心，如果在适宜季节和利用好晴天泡种那就是大大的省了心了，泡种在此期间内，最好是每天需换水1～3次，水要干净无污染，水温不要相差太多为好，换脏水并洗去沾液，同时及时清除莲籽出白沫不能发芽出苗的种子。一般在外部条件都适宜的情况下，超7天仍不发芽的种子，就不会再发芽了。没有发芽能力的种子往往会上浮到水面，胚芽发黄，子叶霉烂、发臭。
水培育苗：种子出苗后，应在25℃左右条件下进行水培育苗5～7天。在水培育苗期间，莲苗根系吸收力弱，生长主要靠种胚提供养分，一般不需要施肥。在水培育苗过程中应保持水层深10厘米左右，并给予充足的光照;不宜经常换水或翻动，以免叶片因经常改变其生长方向而过度伸长;应让叶柄保持在水中，叶片自由平展于水面。移植时应注意，不可折断叶柄，叶是碗莲进行光合作用的，以免影响碗莲的正常生长。最好是选择晴天的傍晚时定植，植后保持3～5厘米水层，但千万不可把叶片淹没水中。碗莲喜光，花钵应放置在阳光充足处。幼苗娇嫩，遇阳光日灼有的会焦枯，但一般还会发芽成活。浇水也不要过多，以提高水温，促进生长。待长出7～13片浮叶后即可出现立叶。一般来说，多花品种，在长出5～17片立叶后可始现花蕾。现蕾早晚，视品种而异，有的品种在立叶长出之前就现蕾开花。