在农作物栽培过程中，由于连年使用化肥，不仅造成土壤板结、肥效日减，还污染了环境，因此，化肥已被列为农业的三个污染源之一。微生物肥料的发展，不但能为农业生产提供新的肥源，还可以减轻化肥污染问题。
　　微生物肥料是从土壤中分离出有益微生物，经过人工筛选和繁育后制成的菌剂，又简称菌肥。
　　一、作用机理
　　　1．增加农作物营养。主要通过菌体代谢过程中产生酸性物质，促使土壤中固定不能被植物吸收利用的矿物质分解，从而释放为速效养分。如硅酸盐细菌肥料，在代谢过程中，释放出大量的无机有机酸性物质，促进土壤中微量元素硅、铝、铁、镁、钼等的释放及螯合，改善土壤中养分的供应情况。
　　　2．刺激和调控植物生长。微生物肥料在施用后的生长繁殖过程中可以产生对植物有益的代谢产物，如硅酸盐细菌肥料可以促进赤霉素、生长素和其他活性物质的产生，这些生长刺激素对作物的生长发育有一定的调节和促进作用。
　　　3．减少或降低植物病虫害。微生物肥料的多种微生物可以诱导植物的过氧化物酶、多酚氧化酶、苯甲氨酸解氨酶、脂氧合酶、几丁质酶、β一1，3葡聚糖酶等参与植物防御反应，利于防病、抗病。有的微生物种类具有分泌抗菌素的功能，抑制或杀死致病真菌和细菌，使病原微生物难以生长繁殖，从而降低了作物病虫害的发生。
　　　4．增强抗旱能力。微生物肥料由于在作物根部大量生长繁殖，菌丝能增加对水分的吸收，使作物抗旱能力提高。
　　　5．改善作物品质。微生物肥料使用后，减少了化肥用量，使农产品品质有良好的改善。有的微生物肥料使用后，可增加产品中的维生素C、糖类和氨基酸含量
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