地基情况千差万别，很正常，做好处理就行了

小水库一般清基不彻底。。。
应该会有坝基残坡土。。。

谈一点个人意见，仅供参考：
水利工程地质勘查资料，一般是根据一定范围内的有限的钻孔、探坑或平峒的岩土力学指标进行推断得到，与实际地质情况可能有差异，针对楼上遇到的问题，建议要求地质勘查人员复核地质资料，然后根据地质资料进行相应的地基处理即可。