你如果一次问这么多的问题，最好是自己去找一本相关的书籍来参考。人不能有太大的依赖心理，要懂得自己动手解决问题，只有在某个问题吃不透的时候，才有针对性的请教别人。
自己动手解决问题的方法如下，仅供参考：
1、找专业书籍；
2、用Google、百度等搜索工具在网上查找相关的内容；

1、如果是推流式的曝气池，取水点不同，其中的微生物也不太同（主要是所占的优势不同），一般取进水端、中间端、出水端。当然你多取几点也是没关系的。越近进水端所看的的指示微生物越低级（移动形纤毛虫占优势，如草履虫），越接近出水端则越高级（固着形纤毛虫占优势，如钟虫、轮虫）。
2、取样后要在现场镜检，时间不能长，不能放任何化学试剂。
3、取沉淀后的污泥，如果太浓可以用去离子水稀。
4、如果你只是运行管理只要看其中的指示微生物就行了，观察那种指示微生物占优势，为运行管理提供帮助（良好的菌胶团其中钟虫占优势）。如果做科研，我也说不清了。
5、不同点取样点，指示微生物所占优势不同。当出现钟虫大量出现，轮虫少量出现，说明水质良好。如果轮虫大量多现说明污泥解絮了。当然在进水端，主要是草履虫占优势的。
6、一天至少做一次。
强烈推荐你看《环境工程微生物学》，高等教育出版社，同济大学一个姓周的老师编著，具体叫什么不清了。
还有论坛上也有大量的微生物图片可以看，对你的学习是很有帮助的。

谢谢两位解答，
谢谢 碧水青山