我认为首先你要设计好你的箱涵调度运行工况，然后联系河道的进行相应的调整
1。要看你所说的大河发洪水，是什么级别的洪水，加上你的泄水是否在安全泄量以内；（若在应该可以排）
2。河道设计中是否考虑了你的泄量；（若考虑了，可以放心大胆的排）
3。你只说了堤高和渠底的关系，不清楚你的水面衔接关系，要注意水面的衔接问题。

楼上说的不错

我也遇到了同样的问题，就是干流修筑防洪堤需要考虑支沟排洪的问题。现在有个问题是，顺着支沟周围有一段区域的地势低于干流的设计洪水位，容易引起洪水倒灌。
我们这的专家要求我们把干流和支沟的洪水频率按同等情况考虑，并采取措施。

所以，请问各位大侠，遇到这种问题，需要怎么样进行考虑才周全。

可以修建排涝站或排涝闸解决。
外河水位高，则关闸、站防倒灌；内河水位低于外河时则开闸排水。若内河内保护对象更重要（如城区、重要设施等）则在外河水位高于内河时也可以用水泵较内涝水抽走。

这个建议很好。但是如果考虑内河也发洪水，并且流量比较大，那设计的水泵功率就很大了，运行起来很困难。 不晓得还有没有其他的方式了？