植草沟的设计难点在于和道路相交时的具体处理： 1）平面交叉 「平面交叉」顾名思义就是植草沟和相交道路在同一标高，采用这类交叉形式的植草沟边坡最大不能超过1:9，以确保车辆安全通行。它的特点是造价低，所需面积大，因此适用于低密度开发区。此外这类交叉形式容易导致雨水在道路路面汇集形成「积水」，因此需要在道路附近加设溢流口（入水口）。
2）垂直交叉
「垂 直交叉」就是植草沟从道路下方以涵管或涵洞的形式穿过。可以把道路作为「阻流墙」之一设置，也可以利用沟底和周边高差把植草沟设计成下游海绵设施的「临时蓄水池」。这类形式比「平面交叉」造价高，且要考虑安全隐患（防治行人或儿童跌落），以及涵管容易被径流携带的沉积物堵塞。
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